Os órgãos da administração do eAmazônia, conforme previsto em seu Estatuto, e que asseguram o contínuo progresso da instituição são: Assembleia Geral, Conselho Fiscal, Conselho de Administração e Diretoria Executiva.
The Assembleia Geral is the maximum deliberative body of the center, being composed of its members: Centrais Elétricas Brasileiras S.A. (Eletrobras) and the Federal University of Acre (Ufac).
The Conselho Fiscal is the accounting-financial inspection body composed of 3 (three) effective members and 3 (three) alternates.
The Conselho de Administração é o órgão colegiado de gestão e de deliberação, constituído por sete membros, ligados às Instituições Eletrobras, Ufac, Seict e Fieac.
The Executive Board is the body whose object is to carry out the management execution of the Entity, being composed of the Chief Executive Officer, Administrative and Financial Director and the Technological Development Director.